本发明属于生物工程与食品技术领域，公开了一种鱼油脱胶脱色方法，包括以下步骤：(1)配置磷脂酶或/和脂肪酶浓度为1‑5000U/mL的酶液，向酶液中添加可溶性盐、亲水性溶剂和鱼油，配成三液相体系；(2)将配置好的三液相体系置于搅拌条件下反应，反应结束后，静置或离心至分四层，收集最上层的鱼油相；(3)将鱼油相加入碱液，然后加入疏水性有机溶剂，静置后取上相，回收疏水性有机溶剂，取萃取上相为精制鱼油。本发明提供了一种利用酶与多液相结合同步从粗鱼油中脱胶、脱色的方法，使工艺得以简化，处理时间短，成本降低，经济可行。