本发明公开了一种草酸生物工程分离设备，包括机体，所述机体的内侧上部安装有导流板，导流板的上侧空间为初步分离腔，导流板的上侧设置有分离板，分离板的内侧设置有承载网板，分离板的中间安装有中心轴，机体的底部还设有与中心轴连接的驱动电机，导流板的下侧于中心轴上安装有二次分离网板，二次分离网板的下侧于机体内侧壁上安装固定有储料板，储料板和机体构成的空间为储料腔。本发明结构紧凑，占地空间小，经过二次分离出的草酸颗粒含废液较少，且形状规则，加工质量好、效率高，提升企业效益，利于投入应用。