本发明提供一种卫星导航区域增强系统的双卫星星历故障监测方法，包括：机载装置接收卫星导航监测设备发送的导航参数，导航参数包括双卫星星历故障的漏检概率和单卫星星历故障的漏检概率、双卫星星历故障的星历去相关参数和单卫星星历故障的星历去相关参数；根据导航参数，利用单卫星星历故障保护级和双卫星星历故障保护级计算公式，获取单卫星星历故障保护级和双卫星星历故障保护级；根据单卫星星历故障保护级和所述双卫星星历故障保护级，获取综合星历故障保护级，能够监测双卫星同时发生故障的概率。