本发明涉及一种镁铝层状复合材料薄壁管材的制备方法，包括（1）将半连铸镁合金铸锭和铝合金铸锭分别进行均匀化处理；（2）将镁合金锭进行等温反挤压；（3）机加工后，利用压力机把经均匀化处理的铝合金锭压入镁合金杯形件中，得到复合材料坯料；（4）首先进行穿孔挤压，然后进行管材挤压，得到层状复合材料管坯；（5）冷加工，获得薄壁管材；（6）清洗和热处理；（7）矫直，获得成品管材。本发明提供的新型轻质薄壁管材制备加工的流程短、成本低，轻质薄壁管材的附加值高，适合于规模化生产，制备的轻质薄壁管材可用于航空、航天和飞行器，具有良好的应用推广前景。