本发明公开了一种吲哚乙酸的多粘类芽孢杆菌快速定向选育方法，包括如下步骤：(1)多粘类芽孢的芽孢化培养；(2)5‑氟色氨酸对多粘类芽孢杆菌生物阻断压力选择；(3)氨基酸协同5‑氟色氨酸对多粘类芽孢杆菌生物阻断压力选择；(4)亚硝基胍(NTG)对多粘类芽孢杆菌的诱变；(5)甘氨酸联合5‑氟色氨酸培养平板定向筛选培养；(6)多粘类芽孢杆菌突变株产吲哚乙酸能力分析。本发明采用NTG诱变联合定向筛选平板培养方案具有选育高效、定向性强、周期短等优势，后代有81％的突变菌株高产吲哚乙酸，达到1mg/mL；其中最高产突变菌株达到2.24mg/mL,是原始野生菌株的28倍。