本发明属于生物工程技术领域，特别涉及一种芽孢杆菌生产甘氨酰组氨酰赖氨酸的方法。该生产甘氨酰组氨酰赖氨酸的方法，其特征为，从试管斜面上挑取芽孢杆菌接种到液体种子培养基中培养，制得液体种子；将液体种子接种到液体发酵培养基中，发酵，调发酵液pH值，滴加氨基酸液，继续发酵，制得含有甘氨酰组氨酰赖氨酸的发酵液；将发酵液过滤，收集滤出液，向滤出液中加入萃取剂，分相，制得含有甘氨酰组氨酰赖氨酸的萃取液，将萃取液真空蒸发，制得甘氨酰组氨酰赖氨酸产品。本发明可以实现甘氨酰组氨酰赖氨酸生产的连续化、规模化；并且甘氨酰组氨酰赖氨酸的生产工艺简便，生产成本较低，极具工业化应用前景。