本实用新型公开了一种生物工程污水处理装置，包括箱体、进水口、密封门、折叠橡胶箱、杀菌箱、紫外线消毒灯、第一水管、第一电磁阀、除菌箱、电热丝、清洁口、密封塞、第二电磁阀、第二水管、集水箱、排水管、水阀、锁槽、伸缩槽、锁舌、弹簧、滑槽和锁杆，所述箱体内部上方安装有杀菌箱，所述箱体侧壁上方开设有进水口，且进水口底部转动连接有密封门，所述杀菌箱靠近进水口一端连通有折叠橡胶箱，且折叠橡胶箱与密封门连接，此生物工程污水处理装置，方便污水的送入与排出，通过紫外线照射和高温加热对污水深度灭菌消毒，而且装置结构简单，适合实验室随地使用，即使处理生物工程产生的污水。