本实用新型公开了一种生物工程污水处理装置，其结构包括底座，本实用新型的一种生物工程污水处理装置，通过在分流管底端设置有净化桶，污水通过净化通内部一级过滤层、二级过滤层和消毒层的逐级过滤与消毒，可使污水变成达标可排放的清水，比传统的污水处理设备过滤与消毒效果更好，解决了现有污水处理设备处理效果差的缺点，通过在水泵右端设置有止逆装置，污水在净化桶经过净化处理后，清水通过进水口b流进去，由于水泵增压使清水带动移动杆向上移动，移动杆对弹簧压缩，清水从传输口流出，当清水低于进水口b时，弹簧反弹使移动杆向下移动，可将传输口堵住，防止清水回流，提高了污水处理的工作效率，解决了容易造成回流现象的缺点。