本发明公开了一种用于生物工程尾气处理系统，包括系统主体，系统主体的一侧设置有进气管，进气管的内表面设置有吸热层，系统主体的内部一侧设置有净化液箱，系统主体的顶部设置有进液口，且进液口位于净化液箱的正上方，该种用于生物工程尾气处理系统，设置有净化液、搅拌轴和扇叶，当尾气排入净化液后，与净化液发生化学反应，将尾气中的有害物质降解为无毒的H2O和CO2，提高了净化的效果，搅拌轴可以将反映室内的尾气搅拌均匀，方便其在反映室内的转化，提高了净化的均匀度，当尾气过多时也可以均匀的净化，由于活性炭层和椰维炭层将系统主体分隔为两层，其通透性低，扇叶可以产生吸力，将反映室17内的尾气吸入，提高了净化的速度。