本实用新型公开了一种基于生物工程的发酵罐搅拌器，其结构包括通气盖、电机、减速机、上盖、辅料口、底座、发酵罐，通气盖下端与上盖上端相嵌合，电机与减速机位于同一轴心，发酵罐包括旋转杆、消泡杆、搅拌轴、搅拌片、震动辅助装置、出料口、内罐，消泡杆与旋转杆位于同一中心线，搅拌轴与消泡杆相平行，本实用新型一种基于生物工程的发酵罐搅拌器，其机构上设置了震动辅助装置，震动辅助装置内部结构电磁铁与衔铁相互吸附再通过弹簧使之复位，与半齿轮在内齿框内转动使内齿框进行重复的往返运动可使震动辅助装置在内罐进行高频振动，配合搅拌器，即使在较大的发酵罐内也可使罐内微生物活跃，提高发酵效果。