本发明公开了胶原蛋白‑羟基磷灰石复合小分子骨材料的制备方法，包括如下步骤：(1)以磷酸水溶液为溶剂，配置I型胶原蛋白溶液；将Ca(OH)2在氮气保护下，溶于去离子水中，配置浓度为Ca2+悬浊液；将小干扰RNA溶于纯净水中，配置小干扰RNA水溶液；(2)将I型胶原蛋白溶液、Ca2+悬浊液和小干扰RNA水在搅拌下，同时滴加到容器中，有絮状沉淀产生，并缠绕在搅拌片上，滴加完毕继续搅拌，抽滤，用去离子水洗涤沉淀，将沉淀在模具中预成型，冷冻干燥，再等静压压制得到。本发明的方法可以将小干扰RNA包裹于胶原蛋白/羟基磷灰石复合中，并通过实验证明，小干扰RNA的释放能够发挥相应的作用。