本发明公开了用于低温土壤修复的微生物制剂，该复合微生物菌剂包括耐冷菌玫红假裸囊菌HD1031菌剂、好氧反硝化耐冷约氏不动杆菌DBP‑3菌剂和固定化氧化还原酶；所述固定化氧化还原酶由固定化棘根过氧化物酶和固定化土壤多酚氧化酶组成。本发明还公开该微生物制剂的制备方法和应用。该用于低温土壤修复的微生物制剂在戊唑醇农药和有机磷农药的去除率均到达了86%以上，氨氮的去除率也到达了85%以上，远远高于现有技术和本发明的对比例中的去除率，因此本发明的用于低温处理的复合微生物菌剂能够有效修复污染土壤，而且制备方法简单，适合大规模生产，为偏远低温地区带来了福利，解决了目前亟待解决的环境污染问题。