本发明公开了一种菌藻活性营养组合物、菌藻活性营养液的制备方法及应用。所述菌藻活性营养组合物包括：蛹虫草1.5‑3.5wt％、螺旋藻2.5‑4.5wt％、川芎1.3‑3.3wt％、枸杞1.2‑3.2wt％、玫瑰花0.7‑2.7wt％、桃花0.4‑2.4wt％、月季花0.6‑1.6wt％、白蔹0.6‑1.6wt％、甘草1.3‑1.8wt％、白芷0.7‑1.7wt％和凤仙花0.3‑1.3wt％。所述菌藻活性营养液由所述组合物提取获得。本发明提供的菌藻活性营养液原料易得，制法简单，其以药食两用的植物为主要原料，应用生物工程技术，将原料内的营养物质萃取出来，予以应用，使各原料内所含物质之间起到相辅相成的作用，对皮肤保湿和疤痕修复、消除皱纹等具有有益效果。