本发明公开了一种小分子酒制备方法及其生产系统，超高压微射流设备在超高压下通过改变阀芯与阀座之间的梯型环形间隙来调节节流面积，产生超高速射流，在反应腔产生巨大压力降后形成高达200MPa～600MPa的静压力，动能的瞬间转化，流体的高速撞击、振荡、膨化、气蚀等作用，产生巨大剪切力，将大分子立体结构中的氢键结合、疏水结合、离子结合破坏，形成0.1‑10纳米的游离小分子，在范德华力的作用下，分子间完成自组装，形成相对稳定的多元小分子化合物，这个过程中，分子量较大的杂醇油含量明显减小，极大地提高了大分子酸、醇、酯、醛、酮化合物向小分子脂肪酸、脂肽、多元醇、芳香烃等转化和缔合的效率，使酒体的口感和品质在较短时间内得到较大幅度的提升。