本发明提供了一种哈维弧菌噬菌体微生态制剂及其制备方法和应用，属于微生物技术领域。所述制备方法是将哈维弧菌液和哈维弧菌噬菌体液接种至发酵培养液中进行发酵培养；在发酵培养进行至6～12h时，向宿主发酵液中流加哈维弧菌液，继续发酵培养，控制整个发酵周期控制在18～24h，发酵液进行灭活哈维弧菌，得到哈维弧菌噬菌体微生态制剂。本发明通过控制发酵流加时机为发酵培养进行6～12h，流加哈维弧菌液，能够实现不延长发酵时间的前提下，大大提高哈维弧菌噬菌体的效价。