本发明公开了一种高效表达来源于雅致放射毛霉的羧肽酶Y的方法，属于生物工程领域。本发明通过构建表达重组质粒pPICZα‑procpy，电转化毕赤酵母GS115，通过不断提高抗生素的方法，筛选得到具有不同拷贝数的表达重组菌株，再往得到的重组菌株中转入来源于毕赤酵母的伴侣蛋白BIP，最终得到一株高效表达来源雅致放射毛霉的羧肽酶Y的表达重组菌株，诱导表达6天之后，表达量达到了525±20mg/L。