本实用新型公开了一种纯化水及其管道灭菌消毒系统，包括储罐(1)、第一循环系统(2)、第二循环系统(3)，所述的储罐(1)顶部设有总回水口(4)，底部设有出水口(5)，第一循环系统(2)和第二循环系统(3)顶部共同汇合于回水管道(6)，通过第一回水管道(6)连接于总回水口(4)；第一循环系统(2)和第二循环系统(3)底部共同汇合于出水管道(7)，通过所述的出水管道(7)连接于出水口(5)；所述的第一循环系统(2)设有射流器(8)，所述的射流器(8)通过管道连接于臭氧发生器；所述的第二循环系统设有紫外杀菌装置(9)。本实用新型结构简单，安装方便，工艺简单，节约能耗，杀菌后的纯化水和管道无臭氧和细菌残留。