本实用新型公开了一种生物样本冷藏运输箱，包括箱体，箱盖，所述的箱体的外壳内设有冷藏箱，蓄冷室，冷藏箱作为内箱设置在箱体内，冷藏箱的外侧设置蓄冷室；冷藏箱与蓄冷室之间的箱壁上设有通气孔，通气孔设有控制开关；冷藏箱顶部设有开口，箱盖封闭冷藏箱的开口；冷藏箱内箱体的底部设有安装腔体，安装腔体设有电池组件，控制器组件，电池组件为控制器组件供电，控制器组件通过控制开关控制通气孔，冷藏箱内设有温度探头，温度探头与控制器组件电连接。当温度控头监测的温度达到设定的上限时，控制器组件通过控制开关打开通气孔，蓄冷室内的冷气输送到冷藏箱，从而实现自动调节冷藏箱内的温度，并可长时间维持温度、记录相关数据。