本实用新型公开了一种大便分析仪的取样系统，包括呈直角连接的水平板和竖直板，所述竖直板上设有搅拌稀释组件，所述水平板上设有吸样组件，所述搅拌稀释组件包括搅拌轴和稀释针，所述搅拌轴连接搅拌电机的输出轴，所述搅拌电机和稀释针间隔安装在一安装座上，所述安装座在第一驱动组件的作动下可上下移动以带动稀释针和搅拌轴插入样品瓶中，所述吸样组件包括吸样针，所述吸样针在第二驱动组件的作动下可水平移动到样品瓶上方并在第三驱动组件的作动下上下移动以吸取经过搅拌稀释的样品。本取样系统通过搅拌稀释组件对大便样品瓶内的样品进行搅拌稀释，再利用吸样针吸取样品并转移到加样位，能够很好的对固态大便样品进行取样。