本发明公开了一种提高微藻固碳效率的方法。通过对衣藻叶绿体型甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶基因进行过表达，强化衣藻光合固碳能力。具体包括甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶基因重组表达载体构建，并通过电击转化将所述甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶基因重组载体转化至莱茵衣藻细胞中，筛选获得甘油醛‑3‑磷酸脱氢酶强化表达转基因莱茵衣藻。微藻通过光合固碳可以合成油脂、蛋白质、淀粉和类胡萝卜素等生物质，而加快微藻生物质生产效率对下游产业有着重要作用。本发明将目的基因转入莱茵衣藻，加快固碳效率，提升其生长速率，在微藻生物工程领域具有显著的应用前景。