本发明涉及属于蓝藻生物工程、藻类分子生物学方向技术领域，特别涉及一种vp28基因和eGFP基因在蓝藻中的融合表达及分析，并构建穿梭载体的方法。本发明根据eGFP在荧光显微镜下受紫外光或蓝光激发后具有绿色荧光特性，通过构建vp28基因和eGFP基因的融合表达载体，充分利用eGFP基因的这一特性，使得vp28基因在聚球藻7942中的表达易于检测和定量分析，对使用转vp28基因的聚球藻作为口服剂，投喂南美白对虾，进行白斑综合征病毒的防治提供可靠依据。