本发明涉及数据库技术领域，提供一种基于共享存储的MySQL数据库系统高可用系统，包括：主数据库、从数据库、数据库运维中心和共享存储服务器，其中，所述主数据库和所述从数据库在所述数据库运维中心的控制下，直接复制数据；所述共享存储服务器中设有与所述主数据库和所述从数据库一一对应的分区，所述分区用于存储相应数据库的binlog文件。本发明只将一直在刷新的日志文件binlog存储在共享存储服务器中，工作正常时，不同数据库只能操作与本数据库相对应的binlog文件，当主数据库出现异常时，主数据库的binlog文件被推送给从数据库，该从数据库可升级为主数据库，并继承主数据库中的所有内容，而当共享存储服务器出现异常时，并不影响各数据库中保存的数据本身。