本发明公开了一种燃气锅炉机组智能操作优化方法及系统。所述方法包括如下步骤：S1、实时采集燃气锅炉机组原始数据；S2、利用数据库管理软件对采集的所述原始数据进行存储和管理；S3、根据所述原始数据建立燃气锅炉机组运行特征方程；S4、根据所述燃气锅炉运行特征方程的各个参数建立燃气锅炉机组优化模型；S5、通过坐标轮换法对所述燃气锅炉机组优化模型求取最优解；S6、根据所述最优解结果进行优化调整。本发明公开的燃气锅炉机组智能操作优化方法及系统通过大数据挖掘技术，坐标轮换法等智能优化算法能从锅炉机组生产数据中，快速获得有价值信息，找出生产实际中的最优操作值，指导操作人员操作运行，为提高热电企业经济效益提供理论支撑。