本发明涉及一种同步角度闪烁的导航干扰信号发射方法与系统，属于卫星信号源控制技术领域，包括信号控制分系统和分布在N个位置的N台信号源，N≥3；信号参数和时间同步指令按照空中接口协议组帧后通过第一无线数传模块的无线链路发送给N台信号源；N台信号源从各个角度周期性地对目标发送非相干信号，形成角度闪烁信号发射；有益效果在于多台信号源的精确时间同步和实施角度闪烁干扰，既造成抗干扰接收机的抗干扰算法失效，接收机无法正常定位，也造成接收端信号测向定位系统无法测定信号源位置坐标。