本发明一种气动光学效应计算方法及系统包括：采用流体力学分析软件分析飞行器的外部气体的温度场数据、压力场数据及密度场数据；根据外部气体的温度场数据、压力场数据及密度场数据及外部气体对折射率的影响关系，计算得到飞行器外部的折射率场数据；通过折射率场数据和设定的等折射率面的选取间隔提取等折射率面，获得离散的等折射率面数据；采用多项式拟合的方式，对等折射率面数据进行拟合，以得到等折射率面的连续函数方程，相邻等折射率面之间的折射率采用同一个等效折射率值代替；将等折射率面的连续函数方程和相邻等折射率面之间的等效折射率值输入到光学设计软件中，通过光学设计软件进行光线追踪，评估气动光学效应引起的光束偏折。