本发明公开了一种导航补偿方法，其主要包括以下步骤：用户发现导航信号差的路段可通过所述客户端自动或由用户手动向服务器端发送起始位置、行驶方向和该路段长度信息，所述起始位置和路段长度作为自主导航起点和自主导航距离；以及服务器端实时监测各个客户端的行驶位置，当发现所述客户端到达所述自主导起点且行驶方向也一致时通知所述客户端开启自主导航模式，自主导航过程中，所述客户端根据行驶时速和行驶时间判断所到达位置，当行驶距离达到自主导航距离时退出自主导航模式。本发明通过以上步骤使得即使在导航设备无法正常接收外部导航信号的情况下，也能够通过自主导航的方式暂时替代原有的导航模式。