本发明提供了一种储能系统电池簇智能调度系统，包括电池簇串并联切换模块、总控制单元、电池管理单元和若干电池簇。本发明还提供了一种智能调度方法，包括：电池管理单元将电池簇的实时信息上传至总控制单元，总控制单元根据使用条件对电池簇串并联切换模块发出控制指令，确定需要串联或并联使用的电池簇，对电池管理单元发出控制指令，使电池管理单元控制相应的电池簇对输入端进行充电。本发明能使电池簇间串并联切换，能够适用于多种负载不同电压、不同容量需求的用电设备，一套储能系统可运行多种场景，能大大降低投资成本，运行效率提高数倍。