本发明公开了一种基于雷达控制球机跟踪多目标的方法及系统，该方法包括：获取待跟踪的所有雷达目标轨迹点的信息；并按径向距离R进行从小到大排序；替换轨迹点：取径向距离R最小的雷达目标轨迹点为圆心以半径r画圆，根据被圆包含的雷达目标轨迹点的数目确定视场中心点，以视场中心点作为球机跟踪轨迹点，并从所有雷达目标轨迹点中删除该圆包含的雷达目标轨迹点；重复“替换轨迹点”步骤，直至完成所有雷达目标轨迹点；将得到的所有球机跟踪轨迹点按时间标签和/或序号标签进行依次关联，控制球机按照球机跟踪轨迹点的关联进行转动跟踪。本发明采用雷达和球机联动监控，在雷达控制球机跟踪多个目标时，能够提供多个目标跟踪的最佳视野。