本发明公开了一种破解图像验证码的方法、系统、电子设备及存储介质，包括步骤：从图像验证码中扣选出区别于背景图的目标图像；提取预先给定的参考图像中的标准验证图像，并确定所述标准验证图像的排列顺序；提取所述目标图像的第一指纹信息和所述标准验证图像的第二指纹信息；将所述第一指纹信息和所述第二指纹信息进行相似度计算；选取与每个所述标准验证图像相似度最高的所述目标图像作为目标点，根据所述标准验证图像的排列顺序选中所述目标点。本发明的破解图像验证码的方法及系统可以快速有效的识别出验证码中的图像，自动破解图像验证码。