本发明提供一种预处理器，该预处理器的算法用于获得系数矩阵A，具体是：将有限差分网格上的节点按照耦合关系的强弱重新排序为四种不同类型的节点，以方便每种类型对应的的节点解除耦合，因为算法中各个类型节点的独立性，该方法是高度并行的一个矢量化算法；获得的系数矩阵的A用于正演计算，能够有效地求解大型线性方程组，该预处理器算法自动满足散度条件，无需额外进行散度校正，能够解决低频情况下迭代求解器收敛缓慢或者不收敛的问题。本发明还公开了一种基于上述预处理器的三维有限差分电磁正演计算方法，计算结果与参考解的误差很小，表明该计算方法的精度高、可靠性好。