本发明公开了一种公司员工考勤管理系统，包括用户资料管理模块、每日考勤管理模块、请假考勤管理模块、出差考勤管理模块、加班考勤管理模块和用户权限管理模块，所述用户权限管理模块包括员工权限和管理者权限、增加权限、删除权限和密码管理权限，所述增加权限、删除权限为管理者权限的子权限，且密码管理权限为员工和管理者共有子权限。本发明通过对不同工况进行分类管理，统一至平台上记录，在经过考勤机和公司出入口监控设备配合到勤记录，实现员工基本信息管理、员工的出勤记录、员工的请假记录、员工的加班记录、员工的出差记录和用户基本信息管理功能，便于数据统计和维护，管理员和员工权限保证上下权限限制功能完善。