本发明提出了一种模块化多电平换流器的并行控制系统及方法。本发明的并行控制系统包括：采集模块、并行排序网络模块、并行调制波生成模块和触发信号生成模块；采集模块采集的信号输出给并行排序网络模块、并行调制波生成模块和出发信号生成模块；其中的，并行排序网络模块与并行调制波生成模块之间互不影响可以并行执行，将其应用于并行设计控制器即可实现并行执行，在保证控制效果的前提下，降低控制器的计算耗时，减小了控制链路延时，一定程度上避免了模块化多电平换流器的系统动态特性恶化和系统振荡失稳。