本发明公开基于形态特征GAN的跨模态MRI合成方法，包括建立MRFE‑GAN模型，包括残差网络模块和模态代表特征提取模块；源模态通过残差网络模块获取到伪目标模态；通过模态代表特征提取模块提取伪目标模态的代表性特征并将其与源模态的基础信息合并，融合生成合成目标模态。本发明能够获得更加真实有效的目标模态；能够有效克服跨域模态之间的信息差异，能够有效地提取不同级别的数据；有效地减少合成模态和真实目标模态的差异，使得合成图像更加真实可靠。