本发明提出了一种风车远程自动控制系统及控制方法，所述控制系统包括制动系统、控制模块、无线通信模块、远程监控终端、数据选择器和移动终端；所述制动系统用于停止风车齿轮箱的工作运转，控制模块分别接收来自无线通信模块和远程监控终端的数据信息，无线通信模块与移动终端通过无线通信进行信号传递，控制模块将来自远程监控终端的控制命令和移动终端的控制命令发送至数据选择器，数据选择器选择性发送其中一种控制命令给制动系统；本发明的控制能够实现不同工作模式的切换，切换方式简单，工作效率高，同时控制方法能够让风车的利用率得到提高，且安全性能良好，具有不错的应用前景。