本发明实施例提供了一种跨异构数据库的数据同步方法、装置、介质及电子设备，该跨异构数据库的数据同步方法包括：查询第一数据库以判断是否完成针对待同步数据的批处理；响应于查询到针对待同步数据的批处理已完成，从所述第一数据库中导出批处理完成的待同步数据，并在导出完成后将导出完成信息存放在记录文件中；查询所述记录文件，响应于查询到导出完成信息向第二数据库导入所述批处理完成的待同步数据。本发明实施例的技术方案通过在进行数据同步之前先对第一数据库进行查询，以判断是否完成针对待同步数据的批处理，防止出现导入第二数据库的数据不完整的情况，从根源上杜绝了数据同步失败的发生。