本发明公开了一种抵抗能量分析的随机混合加密系统及其实现方法，属于信息安全领域。系统采用自上而下一体化的设计方案，由伪随机序列PN128生成模块、S盒更新模块、掩码修正值生成模块、明文输入寄存器、伪随机序列PN64生成模块、选通电路A、选通电路B、SMS4加密模块、AES加密模块、多路器、密文输出寄存器十一个部分组成。本发明首次提出了一种抵抗能量分析的随机混合加密系统及其实现方法，通过伪随机序列PN64，对明文随机采用基于掩码技术的AES或者SMS4算法进行加密，算法硬件实现中所有的基本电路单元均通过对称电路实现，从根本上杜绝了简单和差分能量分析，加密系统具有多种工作模式，适用于不同场景。