本发明公开了一种三维模型数据压缩方法及系统。该三维模型数据压缩方法，包括：获取三维模型的几何网格的几何信息；对几何信息进行小波变换，得到小波系数矩阵；识别三维模型中的感兴趣区域从而将小波系数矩阵划分为感兴趣区域小波系数和背景区域小波系数；采用最大位移法对感兴趣区域小波系数的幅值进行放大，得到感兴趣区域放大系数；对感兴趣区域放大系数和背景区域小波系数形成的系数矩阵进行嵌入式零树小波编码，编码数据；对编码数据进行小波逆变换，得到逆变换数据；根据逆变换数据重建三维模型，得到压缩后的三维模型。本发明的三维模型数据压缩方法及系统能够提高压缩的效率。