本申请实施例公开了一种蛋白质数据获取方法、装置、计算机设备及存储介质，属于计算机技术领域。该方法包括：根据蛋白质的氨基酸序列信息，获取氨基酸序列信息的序列特征，基于数据获取模型，获取蛋白质的第一主链二面角和第一二级结构，基于第一转换模型，获取与第一二级结构对应的第二主链二面角，基于第二转换模型，获取与第一主链二面角对应的第二二级结构。该方法由于第一转换模型的输入为第一二级结构，第二转换模型的输入为第一主链二面角，考虑了二级结构和主链二面角之间的关联关系，保证了获取的第二主链二面角和第二二级结构的一致性，提高了获取的二级结构和主链二面角的精确度。