本发明公开了一种基于SSVEP脑机接口的仪器仪表控制系统，通过基于SSVEP的脑机接口实现对仪器仪表的控制，利用光源刺激装置提供对应于仪器仪表各项功能的刺激目标，即利用光源刺激装置中的刺激目标取代仪器仪表的原始按键，当使用者需要控制仪器仪表执行某种指令时，使用者无需与仪器仪表进行肢体接触，仅需佩戴可穿戴脑电传感器并注视光源刺激装置中与该指令对应的刺激目标即可，这样，使用者仅通过目光注视即可实现对仪器仪表的控制，无需外部神经和肌肉的参与，使用者在操控仪器仪表的过程中可以继续双手的工作，从而可以免去机械手等不必要的外部辅助工具，缩减生产开销，提高操作效率，还可以免除极端条件下重复繁琐的准备工作。