本发明公开了一种具有网络流量整形的航空电子通信中间件系统，该系统包括配置文件解析功能模块、协议转换功能模块与流量整形功能模块；其中协议转换功能模块由数据帧检测单元、帧结构重填单元以及SN插入单元构成。本发明中间件系统基于NDIS模型的改造，通过对数据帧结构重填与SN插入，实现了航空电子全双工交换式网络协议与TCP/IP协议的互相转换，通过内核态的延时数据包发送，实现了对数据包流的整形。最终获得的航空电子通信中间件能够作为普通以太网与航空电子全双工交换式网络的连接部件，实现航空电子应用通信过程透明的在航空电子全双工交换式网络上运行。