本发明涉及一种基于点扩散函数工程的三维轮廓测量方法和系统，基于点扩散函数工程的三维轮廓测量系统包括投影单元、相位调制单元、旋转单元、探测单元及图像重构单元；投影单元用于将发射光调制成周期分布的投影光并将投影光投射于待测物表面；相位调制单元用于接收待测物的反射光并将反射光调制成单螺旋光；旋转单元用于将单螺旋光旋转180度；探测单元用于将旋转前的单螺旋光转换成第一图像数据及将旋转180度后的单螺旋光转换成第二图像数据；图像重构单元与探测单元电连接，用于对第一图像数据及第二图像数据进行处理，以重构待测物的三维轮廓。