一种补偿磁悬浮控制力矩陀螺磁轴承相位滞后的方法，该发明是一种能够用来补偿磁悬浮控制力矩陀螺磁轴承开关功率放大器相位滞后的方法。根据磁悬浮控制力矩陀螺转子的额定转速和系统参数计算额定章动频率，测试功放系统的相频特性并确定在额定章动频率处需要补偿的相位角度，并在测量磁轴承绕组等效电感和电阻的基础上得出双平行不对称采样电阻网络的不对称因子，最后根据不对称因子配置双平行不对称采样电阻网络。本发明属于航天器惯性执行机构控制技术领域，可应用于磁悬浮控制力矩陀螺高转速下的高稳定控制。