本发明公开了一种两进线柜和一母联柜的自动连锁控制系统及操作方法。系统包括ATS022双电源智能控制器、微型断路器1CB、2CB、接触器KM1、KM2、接触器机械连锁VM3、延时继电器KC、延时继电器KO，进线总开关CB1、CB2、母联开关CB3、中间继电器KA1、熔断器FU1、FU2、FU3、端子排X1、X2、X3和指示灯；端子排X1、X2、X3通过柜间连线连接。在无人的情况下，ATS022双电源智能控制器会根据设定的情况自动检测电源的状态，自动投切断路器，并根据柜面上设置的指示灯实时显示断路器的运行状态，又可应用于不同的系统中即安全又节省原料和成本。