一种样品研磨的工作系统及工作方法，控制系统控制着机械臂A从全自动存储设备中将管架与预冷铝模块先后放置在操作台上，然后控制读码器对管架读码后控制机械臂B将管架上的冻存管夹取放入到预冷铝模块中，随后控制液氮罐打开罐口并控制机械臂A将预冷铝模块放入液氮罐中冷却，冷却完成后，控制机械臂A将预冷铝模块放入多样组织研磨仪中，对冻存管内的样品研磨，研磨完成后，控制机械臂A将预冷铝模块取出放置在操作台上，然后控制机械臂B将冻存管放入管架，再利用机械臂A将管架与预冷铝模块先后放入全自动存储设备。本发明做到了对样品研磨的全自动化，减轻了工作人员的工作负担，且对研磨的数据进行统计和分析，提高了样品研磨的效率和质量。