本发明公开了一种核酸提取预处理扩增系统，包括过滤装置、DNA提取装置、混匀装置、PCR扩增装置以及用于驱动液体流动的驱动装置；通过不同试剂依次对样本进行处理的方法，来节省劳动时间，提高人的工作效率。通过精巧的管路设计，使过滤装置、核酸提取的DNA提取装置、混匀装置以及PCR扩增装置等功能单元进行嵌入式一体化整合，以使整体体积显著缩小；且具有结构简单、易于实现和操作的特点，成本低可大面积推广使用；另外，由于PCR扩增装置是基于温度循环，实现聚合酶对核酸分子快速扩增与信号放大，所以检测时间大大降低；另外，可测的试剂种类广泛，例如细菌、病毒、真菌、衣原体、立克次氏体等均可以实现快速检测。