本发明公开一种单泵液滴生成系统，包括单泵、与所述单泵的输出端相连并用于注射水相的水相注射器、与所述水相注射器的注射头连通的导流管、用于夹持所述导流管并调节其末端高度的调节机构、集液瓶、设置于所述集液瓶内并用于盛装油相的离心管，所述导流管的末端伸入到所述离心管内，且所述导流管的末端与所述离心管的底端保持用于生成预设尺寸液滴的预设距离。如此，通过单泵作为动力源驱动水相注射器往导流管内注射水相，再在离心管内盛装油相，使注射出的水相与油相混合生成反应所需液滴，能够在顺利实现数字PCR液滴生成的基础上，降低设备的空间占用和系统结构复杂度，同时缩减研究成本。本发明还公开一种数字PCR装置，其有益效果如上所述。