本申请提供了一种利用瓜菜秸秆酸化奶牛粪污水的方法，具体为：先将新鲜的瓜菜秸秆经过机械压榨产出的液体进行厌氧发酵制得酸化剂，然后将酸化剂加入到奶牛粪污水中进行酸化处理，持续搅拌直至奶牛粪污水的pH为5.0～6.5，然后将干燥且切断后的瓜菜秸秆固体残余物均匀覆盖到奶牛粪污水上，然后贮存一段时间；本申请中的利用瓜菜秸秆酸化处理后奶牛粪污水，在贮存过程中的pH≤6.5，氨挥发减少95％以上，氮素含量提高40％以上，直接还田施用后，相比较未酸化的奶牛粪污水，肥效提高了60％以上，代替了工业用硫酸和磷酸，不仅可以达到酸化奶牛粪污水的目的，增加粪污水养分含量，还解决了瓜菜秸秆难处理的问题。