本发明涉及基因检测技术领域，公开了一种基因检测系统以及基因检测方法。基因检测系统，包括：控制单元、试剂容器单元，设置有标签；标签识别单元，识别各试剂容器的位置；恒温存储单元；离心机；基因检测仪；移液组件；以及周转单元；标签识别单元识别试剂容器单元中各试剂容器的种类以及位置，然后将识别到的信息传递给控制单元，控制单元根据接收到的信息进行分析和计算，计算得出机械臂的运行程序并向机械臂发送控制指令，机械臂根据控制指令进行动作。本发明的基因检测系统通过控制单元实现标签识别单元与周转单元之间的联动，减少人工参与，降低人工成本，具有工作效率高、出错率低的优点，能够提高基因检测系统的检测效率以及准确性。