本发明公开了一种含磷酸锌的海藻酸盐水凝胶抗菌过滤膜的制备方法。首先将可溶性磷酸盐与海藻酸钠充分混合溶解，得到铸膜液。将该铸膜液刮成膜并浸泡于可溶性锌盐水溶液中充分交联，在海藻酸锌水凝胶生成的同时，在水凝胶中原位生成磷酸锌。随后将得到的含磷酸锌的海藻酸锌水凝胶膜浸泡在可溶性钙盐的水溶液中，钙离子夺取海藻酸锌中的部分锌离子生成海藻酸钙，从而得到含磷酸锌的海藻酸盐水凝胶抗菌过滤膜。水凝胶中原位生成的磷酸盐提高了海藻酸盐水凝胶的机械性能，降低了水凝胶的溶胀性能，磷酸锌赋予海藻酸盐水凝胶良好的抗菌性能。该过滤膜在染料脱盐、印染废水脱色、蛋白质及多肽纯化等领域具有良好的应用前景。