本发明提供了一种硝化菌和光合细菌共生的对虾养殖尾水处理系统，该系统包括位于温室大棚内连接的对虾养殖池、沉淀池、硝化菌和光合细菌共生的培养池，对虾养殖尾水从对虾养殖池内产生并进入至沉淀池，经过沉淀池处理后进入至该培养池，经过硝化菌和光合细菌处理后的对虾养殖尾水进入对虾养殖池内循环重复利用，其中，在培养池的流化床内附着生长在悬浮填料上的硝化菌将氨氮及时转化成硝氮，在培养池内的对虾养殖尾水接受光线照射，生成光合细菌并通过同化作用，去除养殖水体中的硫化氢；本发明的培养池内共生的硝化菌和光合细菌不仅能使养殖尾水得到充分处理，并且还能培养出高丰度的光合细菌，从而提高对虾免疫力，抑制水产病害发生。